根據職責，省衛(wèi)生廳設10個職能處（室）：

　　（一）辦公室

　　協助廳領導組織綜合性政策調研，擬定全省衛(wèi)生工作重大政策，負責綜合協調機關政務工作，制訂廳機關各項工作制度和管理制度，負責會議組織、秘書事務、機要保密、機關財務、行政事務、新聞和宣傳、資產、房產、信息、統計、檔案管理及信訪、保衛(wèi)工作。

　　（二）規(guī)劃財務處

　　研究提出全省衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展規(guī)劃，統籌規(guī)劃與協調全省衛(wèi)生資源配置；負責全省衛(wèi)生信息統計、年報匯總的管理；指導區(qū)域衛(wèi)生規(guī)劃工作；擬定衛(wèi)生財務管理規(guī)范，研究提出衛(wèi)生服務價格建議，執(zhí)行國家衛(wèi)生裝備標準，協調國外衛(wèi)生貸款的利用工作；對直屬單位的計劃、財務、基建、國有資產等進行監(jiān)督管理，負責組織直屬單位法定代表人的離任審計；負責全省性的衛(wèi)生、血防專項經費的管理。

　　（三）衛(wèi)生法制與監(jiān)督處

　　擬定地方性衛(wèi)生立法規(guī)劃，組織協調地方性衛(wèi)生法規(guī)、規(guī)章、技術規(guī)范、標準的擬定；負責衛(wèi)生行政復議和對衛(wèi)生執(zhí)法的監(jiān)督；監(jiān)督管理傳染病、地方病、職業(yè)病防治和食品、職業(yè)、環(huán)境、放射、學校衛(wèi)生，監(jiān)督實施食品、化妝品質量管理規(guī)范并負責認證工作；負責健康相關產品檢驗機構和公共衛(wèi)生監(jiān)測、檢驗機構的認定；負責對全省衛(wèi)生執(zhí)法監(jiān)督工作的指導協調。

　　（四）基層衛(wèi)生與婦幼保健處

　　研究擬定農村衛(wèi)生、社區(qū)衛(wèi)生服務的發(fā)展規(guī)劃和服務標準，指導初級衛(wèi)生保健規(guī)劃的實施；研究城市基層衛(wèi)生服務體系的改革；實施婦幼衛(wèi)生和提高出生人口素質工作的發(fā)展規(guī)劃、政策措施和技術標準；監(jiān)督母嬰保健專項技術的實施；統籌協調健康教育工作。

　　（五）醫(yī)政處（干部保健處）

　　研究指導醫(yī)療機構改革，擬定醫(yī)療機構的發(fā)展規(guī)劃、管理法規(guī)和服務標準，組織指導分級評審；實施醫(yī)務人員執(zhí)業(yè)標準和從業(yè)許可證制度；實施醫(yī)務人員服務規(guī)范；對醫(yī)療機構的醫(yī)療質量和服務質量進行監(jiān)督；依法監(jiān)督管理血站、單采血漿站的采供血及臨床用血質量；協助地方人民政府和有關部門對重大人員傷亡事件組織緊急救護；負責省保健委員會確定的保健對象的醫(yī)療保健工作，制訂干部保健規(guī)劃，協調指導干部保健工作。

　　（六）疾病控制處

　　擬定傳染病、地方病、慢性非傳染性疾病及公共衛(wèi)生相關疾病的防治規(guī)劃和措施，組織對重大傳染病、地方病的綜合防治；授權發(fā)布檢疫傳染病和監(jiān)測傳染病名錄及疫情；組織實施計劃免疫工作，組織調度全省衛(wèi)生技術力量開展救災防病工作，對重大突發(fā)疫情、病情實施緊急處置，防止和控制疫情、疾病的發(fā)生和蔓延。

　　（七）科技教育處

　　研究擬定衛(wèi)生科技長遠規(guī)劃、年度計劃和重點醫(yī)學科技發(fā)展規(guī)劃，擬定基礎性研究、重大疾病研究、應用研究的政策和措施；組織協調醫(yī)學科研攻關和科技成果的普及應用；指導直屬醫(yī)學院校的教學工作，協助有關部門做好醫(yī)學院校的專業(yè)設置、招生計劃和畢業(yè)生就業(yè)計劃的有關工作；會同有關部門制訂衛(wèi)生系統成人教育和繼續(xù)教育政策和計劃工作。

　　（八）國際合作處

　　組織指導醫(yī)療衛(wèi)生方面的政府與民間的多邊、雙邊合作交流和衛(wèi)生援外工作；組織參與國際組織倡導的有關衛(wèi)生方面的重大活動及衛(wèi)生領域的交流與合作；審核各類人員的出國手續(xù)；完成省人民政府交辦的其它醫(yī)藥衛(wèi)生外事活動。

　　（九）省血吸蟲病防治辦公室

　　研究擬定全省血吸蟲病防治工作的中長期規(guī)劃和年度計劃并組織實施和監(jiān)督檢查，協調各有關部門做好血吸蟲病防治工作，組織對基本消滅血吸蟲病的縣（市、區(qū)）的考核鑒定；管理直屬血防單位的醫(yī)療防治和科研、宣教工作。

　　（十）人事處

　　擬定廳機關和直屬單位人事管理的規(guī)章制度，負責廳機關國家公務員制度的實施和人員編制的管理；指導衛(wèi)生專業(yè)技術人員的資格認定工作；研究制訂衛(wèi)生人才發(fā)展規(guī)劃、負責直屬單位的機構編制、勞動工資、人事管理及干部任免的有關工作；承辦衛(wèi)生系統全省性和全國性表彰的推薦工作。

　　機關黨委。負責廳機關和直屬單位的黨群工作。

　　紀檢（監(jiān)察）機構按有關規(guī)定設置，人員編制在機關行政編制總額內單列。